Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
OtcP11725 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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OtcP11725 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtcP11725 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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