Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 4930590L14Rik-201ENSMUST00000196030 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hoxb4P10284 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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