Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxc9P09633 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms