Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcP06800 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PtprcP06800 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PtprcP06800 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PtprcP06800 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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PtprcP06800 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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PtprcP06800 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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PtprcP06800 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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PtprcP06800 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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PtprcP06800 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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PtprcP06800 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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PtprcP06800 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprcP06800 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprcP06800 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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