Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P06344 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P06344 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P06344 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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