Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
P01852 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01852 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01852 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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