Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Lnx1O70263 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lnx1O70263 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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