Protein–RNA interactions for Protein: O55038

Cxcl13, C-X-C motif chemokine 13, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl13O55038 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Cxcl13O55038 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cxcl13O55038 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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