Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DffaO54786 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
DffaO54786 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DffaO54786 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DffaO54786 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DffaO54786 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DffaO54786 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DffaO54786 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
DffaO54786 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DffaO54786 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
DffaO54786 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
DffaO54786 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
DffaO54786 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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