Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Atf6bO35451 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Atf6bO35451 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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