Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Foxd2O35392 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms