Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Kcns1O35173 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Kcns1O35173 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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