Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Kcnk3O35111 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Kcnk3O35111 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Kcnk3O35111 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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