Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm17078M0QW51 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.8 ms