Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm20939L7N243 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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