Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm3542K7N6U2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3542K7N6U2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms