Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8888J3QPX5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms