Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm21976J3QNN2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms