Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

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Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc180J3QNE4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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