Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm3415J3QMS8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3415J3QMS8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3415J3QMS8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm3415J3QMS8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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