Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm3336J3QMQ6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm3336J3QMQ6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm3336J3QMQ6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Gm3336J3QMQ6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm3336J3QMQ6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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