Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem200cJ3QK46 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms