Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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Cldn34c3J3QJW5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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