Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf4bG5E8Z2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Taf4bG5E8Z2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Taf4bG5E8Z2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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