Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ScaperF8VQ70 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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