Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tulp2-209ENSMUST00000210813 2153 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Frk-202ENSMUST00000170771 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Nsg2-202ENSMUST00000093219 1974 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Rab2b-203ENSMUST00000167116 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Abcb1b-201ENSMUST00000009058 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Wfs1-202ENSMUST00000166339 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Trip12-201ENSMUST00000027421 9632 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Olfr1395-202ENSMUST00000203377 2883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Nek10-202ENSMUST00000112630 3348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cep135-201ENSMUST00000049060 5313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Pde8b-210ENSMUST00000162412 4035 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 D7Bwg0826e-201ENSMUST00000208484 3795 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Timeless-205ENSMUST00000105244 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Zfp871-202ENSMUST00000159086 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm37409-201ENSMUST00000195811 1626 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Olfr324-202ENSMUST00000214990 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms