Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20671F6TVX7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20671F6TVX7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20671F6TVX7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20671F6TVX7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20671F6TVX7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20671F6TVX7 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20671F6TVX7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20671F6TVX7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Gm20671F6TVX7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Gm20671F6TVX7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm20671F6TVX7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm20671F6TVX7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm20671F6TVX7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm20671F6TVX7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm20671F6TVX7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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