Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Herc6F2Z461 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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