Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1P8

Irf2bp2, Interferon regulatory factor 2-binding protein 2, mousemouse

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2bp2E9Q1P8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Irf2bp2E9Q1P8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Irf2bp2E9Q1P8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
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Irf2bp2E9Q1P8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Irf2bp2E9Q1P8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Irf2bp2E9Q1P8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Irf2bp2E9Q1P8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Irf2bp2E9Q1P8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Irf2bp2E9Q1P8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Irf2bp2E9Q1P8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Irf2bp2E9Q1P8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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