Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb3D3Z6J4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms