Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Kif28pD3YXS5 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms