Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SafbD3YXK2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms