Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rd3lB2RV38 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rd3lB2RV38 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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