Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Usf3B2RUQ2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms