Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Olfr749-202ENSMUST00000214290 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Apba1B2RUJ5 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms