Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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