Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
H2-M5A7VMS3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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