Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rtf1A2AQ19 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtf1A2AQ19 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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