Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Syndig1A2ANU3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms