Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccdc163A2AGD7 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms