Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pramef6A2A8M8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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