Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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