Protein–RNA interactions for Protein: S4R185

Gm26938, Predicted gene, 26938 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26938S4R185 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26938S4R185 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26938S4R185 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26938S4R185 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26938S4R185 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26938S4R185 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26938S4R185 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26938S4R185 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm26938S4R185 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm26938S4R185 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm26938S4R185 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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