Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gria4Q9Z2W8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gria4Q9Z2W8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gria4Q9Z2W8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms