Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc23a1Q9Z2J0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc23a1Q9Z2J0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc23a1Q9Z2J0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc23a1Q9Z2J0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc23a1Q9Z2J0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms