Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mbd3Q9Z2D8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mbd3Q9Z2D8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms