Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z211

Pex11a, Peroxisomal membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex11aQ9Z211 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pex11aQ9Z211 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pex11aQ9Z211 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pex11aQ9Z211 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pex11aQ9Z211 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pex11aQ9Z211 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pex11aQ9Z211 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex11aQ9Z211 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex11aQ9Z211 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex11aQ9Z211 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex11aQ9Z211 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex11aQ9Z211 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex11aQ9Z211 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pex11aQ9Z211 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms