Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RfxankQ9Z205 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RfxankQ9Z205 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RfxankQ9Z205 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms