Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X9

Cdc45, Cell division control protein 45 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc45Q9Z1X9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc45Q9Z1X9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc45Q9Z1X9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdc45Q9Z1X9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms