Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sumo3Q9Z172 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sumo3Q9Z172 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms